Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca4bQ3UW98 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms