Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf48Q3US17 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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