Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E330014E10RikQ3UL33 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E330014E10RikQ3UL33 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms