Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms