Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LbrQ3U9G9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms