Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam178bQ24JP3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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