Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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Shroom4Q1W617 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shroom4Q1W617 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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Shroom4Q1W617 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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Shroom4Q1W617 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shroom4Q1W617 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
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