Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms