Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms