Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Kndc1Q0KK55 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kndc1Q0KK55 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms