Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms