Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cnn1Q08091 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cnn1Q08091 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cnn1Q08091 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms