Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp2Q06649 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms