Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cab39Q06138 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39Q06138 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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