Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs3Q05895 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs3Q05895 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms