Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apoc2Q05020 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms