Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms