Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcr5Q04683 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms