Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Crisp3Q03402 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Crisp3Q03402 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms