Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mc1rQ01727 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms