Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb2Q00977 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms