Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbp4Q00724 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms