Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms