Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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SgcgP82348 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SgcgP82348 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SgcgP82348 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SgcgP82348 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SgcgP82348 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SgcgP82348 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcgP82348 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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SgcgP82348 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SgcgP82348 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SgcgP82348 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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