Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfbiP82198 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms