Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx2P81066 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms