Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprn2P80560 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms