Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms