Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf6P70279 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf6P70279 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms