Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms