Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms