Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms