Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnnP61807 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnnP61807 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnnP61807 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms