Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms