Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcmtd1P59913 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms