Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms