Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm2P58774 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms