Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp3P57722 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp3P57722 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms