Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TdgP56581 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TdgP56581 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TdgP56581 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TdgP56581 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TdgP56581 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TdgP56581 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms