Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms