Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtskP55097 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtskP55097 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtskP55097 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms