Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cux1P53564 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cux1P53564 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux1P53564 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux1P53564 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux1P53564 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux1P53564 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms