Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cav1P49817 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms