Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cox8bP48772 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms