Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LmnaP48678 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LmnaP48678 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms