Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf4P43488 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms