Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms