Protein–RNA interactions for Protein: P39039

Mbl1, Mannose-binding protein A, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl1P39039 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl1P39039 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl1P39039 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl1P39039 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl1P39039 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl1P39039 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl1P39039 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl1P39039 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl1P39039 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbl1P39039 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms