Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppm1bP36993 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms