Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Hoxd10P28359 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Hoxd10P28359 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms